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college colloquium--Random batch molecular dynamics

发布日期:2024-04-11 点击数:

报告人:徐振礼(上海交通大学)

时间:2024年04月15日 10:30-

地点:理科楼LA106


摘要:The development of efficient methods for long-range systems plays important role in all-atom simulations of biomolecules and materials science. This talk reviews recent progress of random batch molecular dynamics, including random-batch Ewald and random-batch sum-of-Gaussians (SOG) method. These algorithms take advantage of the random minibatch strategy for the force calculation between particles, leading to an order N algorithm. It is based on the Ewald or the SOG splitting of the Coulomb kernel and the random importance sampling is employed for the Fourier part, thus avoiding the use of the FFT and greatly improving the scalability of the molecular simulations. The treatment of the short-range interactions by using random batch idea, energy stable scheme and the software development are also present. Numerical and application examples are presented to show the attractive performance of our methods.


简介:徐振礼,上海交通大学教授。中国科学技术大学本硕博,曾任美国北卡罗莱纳大学夏洛特分校博士后、德国斯图加特大学洪堡学者。2010年任上海交通大学特别研究员,2016年晋升正教授,2019-2021年任数学学院副院长,2021年起任教务处副处长。2010年入选新世纪优秀人才计划,2012年中组部青年拔尖人才计划,2023年获国家自然科学基金杰出青年基金。担任AAMMCMSMCA等杂志编委。曾获上海市和国家级教学成果奖,上海交通大学十大科技进展等。研究方向为快速算法和高性能计算、分子动力学算法和偏微分方程的数值方法等,发表80多篇研究论文。


邀请人:邱越


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重庆大学数学与统计学院的前身是始建于1929年的重庆大学理学院和1937年建立的重庆大学商学院,理学院是重庆大学最早设立的三个学院之一,首任院长为数学家何鲁先生。
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