附属中心医院临床数据研究中心主任，研究员
邮箱：zoulingyun@cqu.edu.cn
学习经历
2004.02-2008.09国防科技大学人工智能与模式识别专业研究生、博士
2001.09-2003.12国防科技大学人工智能与模式识别专业研究生、硕士
1997.09-2001.06国防科技大学自动控制专业本科、学士
工作经历
2022.04-今重庆大学附属中心医院（重庆市急救医疗中心）临床数据研究中心主任
2018.06-2022.03暨南大学附属深圳宝安区妇幼保健院研究所PI、科教科主任、妇幼大数据中心负责人
2008.07-2018.06 陆军军医大学（第三军医大学）微生物学教研室讲师、副教授、副主任
研究方向、教学课程
邹凌云，工学博士，曾任第三军医大学生物信息学中心负责人兼微生物学教研室副主任、暨南大学附属深圳市宝安区妇幼保健院妇幼研究所PI、硕士生导师、深圳市高层次人才，研究领域为生物信息学算法和工具、临床大数据挖掘与应用、微生物组与复杂疾病等。
一、善于指导，长于教学。主持建设了第三军医大学本科生、研究生《基因组与生物信息学》系列课程、生物信息学高性能计算平台、暨南大学妇幼医学研究所生物信息学分析平台、深圳宝安妇幼大数据中心，为临床医学八年制、生物技术、医学实验技术本科生、研究生授课2000多学时，开展生物信息学技术服务1000多次，完成重庆市高等教育改革研究重大课题1项，获得第三军医大学教学成果一等奖1项，参编国家“十一五”、“十二五”规划教材《生物信息学》，举办各类生物信息学培训班9次，作为指导教师指导学生获得“国际遗传工程机器设计大赛iGEM”金奖（2016）。
二、勤于研究，专于所长。擅长以人工智能和生物信息学方法研究生物医学中的复杂科学问题，精通基因组分析、多组学整合分析、机器学习建模等方面的方法和技术，在Briefings in Bioinformatics、Bioinformatics、Autophagy等期刊发表研究论文52篇，其中SCI期刊收录30篇、EI核心收录6篇（其中第一作者和通讯作者SCI、EI论著18篇）。开发eccDNAdb、T4EffPred等软件和数据库5个，获得发明专利、软件著作版权4项。担任中国妇幼保健协会生物样本与生物信息数据挖掘与应用分会常委、广东省精准医学应用学会医学大数据与人工智能专委会常委、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会委员等学术职务。
成果：1.文章2.专利3.项目4.获奖
一、以通讯(#)/第一作者(*含共同)发表的代表性SCI收录论文5篇
1. Cong Zeng*, Lingyun Zou#. An account of in silico identification tools of secreted effector proteins in bacteria and future challenges. Briefings in Bioinformatics, 2019 Jan 18;20(1):110-129. (IF 9.01)
2. Huifeng Pi*, Min Li*,Lingyun Zou*, Min Yang , Ping Deng , Tengfei Fan , Menyu Liu , Li Tian , Manyu Tu , Jia Xie , Mengyan Chen , Huijuan Li , Yu Xi , Lei Zhang , Mindi He , Yonghui Lu , Chunhai Chen , Tao Zhang , Zheng Wang , Zhengping Yu , Feng Gao, Zhou Zhou. AKT inhibition-mediated dephosphorylation of TFE3 promotes overactive autophagy independent of MTORC1 in cadmium-exposed bone mesenchymal stem cells. Autophagy, 2019,15(4): 565-582.（IF 11.1）
3. Xia Zhao*, Zhujun Zhang, Bin Hu, Wei Huang, Chao Yuan, Lingyun Zou#. Response of Gut Microbiota to Metabolite Changes Induced by Endurance Exercise. Frontiers in Microbiology, 2018 , 9 :765 (IF 6.06)
4. Lingyun Zou*, Chonghan Nan, Fuquan Hu#. Accurate prediction of bacterial type IV secreted effectors using amino acid composition and PSSM profiles. Bioinformatics, 2013, 29(24): 3135-3142. (IF 5.323)
5.Rui Ma, Lingyun Zou#. Stillbirth trends by maternal sociodemographic characteristics among a large internal migrant population in Shenzhen, China, over a 10-year period: a retrospective study. BMC Public Health, 22(1):325;(IF 4.135 )
二、主要专利5项
能与血管表皮生长因子受体特异结合的多肽及其运用（ZL201110043529.8,）
一种预测细菌IV型分泌系统效应分子的方法（201610222292.2）
三、目前承担的代表性科研项目5项
1. 国家自然科学基金委面上项目““细菌VI型分泌系统稳定肠道菌群结构的计算模型和方法研究””，52万，2018.01-2021.12；
2. 国家自然科学基金委面上项目“基于特征挖掘和机器学习的细菌VI分泌系统效应分子的功能分类、计算预测和实验验证”，57万，2016.01-2019.12；
3. 国家自然科学基金青年基金““细菌IV分泌系统效应分子的特征挖掘、计算预测和初步实验鉴定研究”，18万，2014.01-2016.12；
4.深圳市基础研究面上项目（深圳市自然科学基金）“孕产妇静脉血栓栓塞临床智能预警模型及相关算法研究”，19万，2020.06-2023.12；
5.重庆大学附属中心医院科研启动基金，50万，2022.10-2024.10
四、代表性奖励和荣誉5项
2016年国际遗传工程机器设计竞赛金奖，指导教师
