教育部重点实验室

·光电技术及系统教育部重点实验室

·三峡库区生态环境教育部重点实验室

·山地城镇建设与新技术教育部重点实验室

·生物流变科学与技术教育部重点实验室

·低品位能源利用技术及系统教育部重点实验室

·信息物理社会可信服务计算教育部重点实验室

·复杂系统安全与控制教育部重点实验室

·非线性分析数学与应用教育部重点实验室

教育部工程研究中心

·工业CT无损检测教育部工程研究中心

·肿瘤与病菌靶向新药创制教育部工程研究中心

教育部战略研究培育基地

·重庆大学区域经济与科教战略研究中心

教育部国际合作联合实验室

·绿色建筑与人居环境营造国际合作联合实验室

·轻合金材料国际合作联合实验室

其它部委平台

·农业部农作物生态环境安全监督检测测试中心（重庆）

·国家生物产业基地公共实验中心（国家发改委）

·国家大学科技园（科技部、教育部）

·煤矿灾害预防与处置应急管理部重点实验室

·民政部政策理论研究基地

重庆市重点实验室

·输变电安全科学与电工新技术重庆市重点实验室

·轻金属科学与技术重庆市重点实验室

·三峡库区水环境安全与生态环境重庆市重点实验室

·现代物流重庆市重点实验室

·软件理论与技术重庆市重点实验室

·非均质材料力学重庆市重点实验室

·数字影视艺术理论与技术重庆市重点实验室

·洁净能源与特色资源高效利用化工过程重点实验室

·生物感知与智能信息处理重庆市重点实验室

·金属增材制造（3D打印）重庆市重点实验室

·材料基因组工程重庆市重点实验室

·天然产物全合成与创新药物研究重庆市重点实验室

·钒钛冶金及新材料重庆市重点实验室

·软凝聚态物理及智能材料研究重庆市重点实验室

·智慧无人系统重庆市重点实验室

·分析数学与应用重庆市重点实验室

·工程结构抗震防灾重庆市重点实验室

·植物激素与发育调控重庆市重点实验室

·空天地网络互联与信息融合重庆市重点实验室

·理论与计算化学重庆市重点实验室

·肿瘤转移与个体化诊治转化研究重庆市重点实验室

·强耦合体系微观物理重庆市重点实验室

·风工程及风资源利用重庆市重点实验室

·先进模具智能制造重庆市重点实验室

·乳腺癌智能诊疗重庆市重点实验室

·急诊医学重庆市重点实验室

重庆市技术创新中心

·重庆市极端电磁脉冲生物效应技术创新中心

·重庆市绿色制造技术创新中心

·重庆市轻量化材料技术创新中心

重庆市工程技术研究中心

·重庆市镁合金工程技术研究中心

·重庆市网络化制造工程技术研究中心

·重庆市材料表面精密加工及成套装备工程技术研究中心

·重庆市微光机电工程技术研究中心

·重庆市杀虫真菌农药工程技术研究中心

·重庆市医疗电子工程技术研究中心

·重庆市机电传动与智能控制工程技术研究中心

·重庆市交通物联网工程技术研究中心

·重庆市血液净化装备工程技术研究中心

·重庆市高性能混凝土工程技术研究中心

·重庆市无线电能传输工程技术研究中心

·重庆市特种通信与组网工程技术研究中心

·重庆市生物医学电磁技术与数字诊疗设备工程技术研究中心

·重庆市生智能交通（ITS）工程技术研究中心

重庆市基础学科研究中心

·重庆市量子物理基础学科研究中心

重庆市野外科学观测研究站

·三峡库区库岸滑坡灾害重庆市野外科学观测研究站

·三峡库区河湖生态系统重庆市野外科学观测研究站

重庆市临床医学研究中心

·重庆市肿瘤学临床医学研究中心

·重庆市内分泌代谢病学临床医学研究中心

·重庆市老年疾病临床医学研究中心

重庆市国际联合研发中心

·低碳高性能水泥基材料国际联合研发中心

·中新无线电能传输技术国际联合研发中心

·中-美重庆大学帕克国际联合研发中心

·中-欧建筑节能与绿色建筑质量保障国际联合研发中心

重庆市工程研究中心

·环保重庆市工程研究中心

·多能互联互补分布式能源技术及系统重庆市工程研究中心

·能源互联网与智能电力装备重庆市工程研究中心

·智慧无人系统重庆市工程研究中心

·肿瘤临床多组学大数据应用重庆市工程研究中心

·山地人居环境工程与综合技术重庆市工程研究中心

·无线电能传输技术重庆市工程研究中心

·高性能集成电路重庆市工程研究中心

·先进铸造重庆市工程研究中心

协同创新中心(2011计划)

·山地城镇建设防灾与减灾重庆市协同创新中心（市级）

·重庆市深空巡视探测协同创新中心（市级）

·能源互联网与智能装备重庆市协同创新中心（市级）

·钢结构与建筑工业化协同创新中心（市级）

·地方政府治理协同创新中心（市级）